雷克萨斯CT200h的缺点主要包括以下几个方面：

1. 油耗偏高：虽然CT200h是一款混合动力车型，但在实际使用过程中，其油耗表现可能偏高，尤其是在城市拥堵路况下。

2. 保值率相对较低：相对于其他豪华品牌车型，雷克萨斯CT200h的保值率可能相对较低，这可能与市场竞争激烈有关。虽然新车落地价可能较高，但在二手车市场上其保值能力可能并不理想。

3. 配件价格较高：作为豪华品牌车型，雷克萨斯CT200h的配件价格通常较高，因此维护成本相对较高。虽然质量上得到保障，但高昂的配件价格可能会让一些车主望而却步。

4. 空间表现不够理想：雷克萨斯CT200h在车内空间表现上可能不够理想，尤其是后排腿部空间相对局促。对于追求宽敞驾乘体验的消费者来说，可能会感到不满意。

5. 操控性能一般：虽然CT200h在舒适性方面表现不错，但在操控性能方面可能相对一般。与某些同级别车型相比，其操控性能可能不够出色。

以上缺点仅供参考，不同的人对同一款车的评价可能会有所不同。建议根据自己的需求和预算选择合适的车型。